で、インストールの時に必要だったBIOS偽装をやってから起動してみたらライセンス有効のままだった。

Windows XPの時はそんなことなかったので気にしてなかったが、XPはDSP版のインストールディスクで普通にVirtualbox上でインストールしているから新規のVMとハードウェア情報が同じなので問題ない。
リカバリからVMを作成した場合はインストールの際に偽装が必要だから、新規VMとハードウェア情報が違うとライセンスが切れちゃう。
ってことかな。