内側プチプチにする理由は主にテープ留めがしやすいという理由ぽい。
クッション効果はどっちでも変わらないとのことだが、一点に衝撃入った時考えると内側がプチプチの方が良い気がする。

商品にプチプチ跡がつかないようにとか、引っ掛かり防止のためとかの理由で外側プチプチ派もいるぽい。

自分の場合は外側にプチプチを向けるものだと思いこんでたので他に理由もなく外側プチプチにしてた。
内側プチプチが主流なら相手に誤解与えないためにもそっちの方が良いと思うんで今度から内側プチプチにする。